Pacientom odporúčame čistiť strojček až po dočistení zúbkov, pretože na jeho čistenie stačí použiť zubnú pastu, ktorá zostala na kefke. Strojček držíme v ruke a jeho živicovú doštičku kefkou očistíme z oboch strán. Následne ho na pár minút, ponoríme do roztoku pozostávajúceho z vody a čistiacej tabletky, ktorá je bežne dostupná v lekárni. Roztok s čistiacou tabletkou stačí použiť 1-2x do týždňa. Potom strojček opláchneme pod tečúcou vodou, otrasieme a odložíme do krabičky.